MIKROBIOLOGI LINGKUNGAN
Mikrobiologi Lingkungan (PIB16051) merupakan mata kuliah pilihan semester gasal bagi mahasiswa S1 Program Studi Biologi Fakultas MIPA Universitas Mataram. Bobot mata kuliah 3 SKS (2 SKS teori dan 1 SKS praktimum). Mahasiswa dapat memprogramkan mata kuliah ini jika sebelumnya telah menempuh mata kuliah Mikrobiologi (BIO16411) dan Fisiologi Mikrob (BIO16507).
Materi kuliah Mikrobiologi Lingkungan meliputi:
1) Mikrobiologi lingkungan dan metode mempelajarinya; 2) Kehidupan mikrob dalam biofilm; 3) Quorum sensing; 4) Biodegradasi senyawa
xenobiotik; 5) Bioremediasi lahan tercemar; 6) Monitoring kualitas air dengan memanfaatkan mikrob; 7) Mikrob penghasil metan dalam konteks pemanasan global; 8) Dampak perubahan iklim terhadap mikrob
dilingkungan perairan laut; 9) Pengaruh
lingkungan terhadap perkembangan mikrob patogen; 10) Genetic
modified organism dan adakah pengaruhnya terhadap lingkungan ?
Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa diharapkan mampu:
1) Membuat ulasan mengenai isu/permasalahan lingkungan terkini (lokal & global) dan merumuskan penyelesaian masalah dengan melibatkan mikrob; 2) Melakukan presentasi tentang aspek biologi biofilm dan mekanisme quorum sensing yang terjadi dalam komunitas mikrob biofilm; 3) Membuat paper/kajian mengenai Genetic modified organism dan pengaruhnya terhadap lingkungan.
Referensi:
Mitchell R and Ji-Dong Gu. 2010.Environmental Microbiology, 2nd Ed., John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey
Madigan MT. et al. 2012. Brock: Biology of Microorganisms, 13th Ed., Pearson Education Inc.
MIKROBIOLOGI TANAH
Mikrobiologi Tanah (PIB16013) merupakan mata kuliah pilihan semester gasal bagi mahasiswa S1 Program Studi Biologi Fakultas MIPA Universitas Mataram. Bobot mata kuliah 3 SKS (2 SKS teori dan 1 SKS praktikum). Mahasiswa dapat memprogramkan mata kuliah ini jika sebelumnya telah menempuh mata kuliah Mikrobiologi (BIO16411) dan Fisiologi Mikrob (BIO16507).
Materi kuliah Mikrobiologi Tanah meliputi:
1) Microbiology of natural soil; 2) Microbiology of dry-land soil North Lombok and other extreme soils; 3) Soil microbe and nutrient cycling; 4) The role of microbial communities in the formation and decomposition of SOM; 5) Intimate association of beneficial soil microbe with host plant; 6) Soil-borne pathogen and the interaction with the soil environment; 7) Utilizing soil microbes for biocontrol (biocontrol development); 8) The impact of land-use practices on soil microbes and sustainable agriculture; 9)The effects of plant breeding on soil microbe; 10) Evaluating the economic and social impact of soil microbe.
Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa diharapkan mampu:1) Membandingkan keanekaragaman mikrob pada berbagai jenis tanah; 2) Menganalisis hubungan mikrob tanah, land-use practises, dan perubahan iklim dalam konteks pertanian berkelanjutan ; 3) Membuat ulasan jurnal/proposal/mini project mengenai aplikasi mikrob tanah.
Referensi:
Geoffrey R Dixon, Emma L Tilson. 2010. Soil Microbiology and Sustainable Crop Production. 6th. New York: Springer.
Moat A.G., Foster J.W., Spector M.C. 2002. Microbial Physiology. 4thEd.,. John Willey & Sons, Inc.
Madigan M.T. et al. 2012. Brock: Biology of Microorganisms, 13th Ed., Pearson Education Inc.
Mikroteknik
SILABUS MATA KULIAH MIKROTEKNIK
1. Deskripsi Mata Kuliah:
Mikroteknik dengan kode matakuliah BIO16504, 3 (1-2) SKS, merupakan salah satu mata kuliah keahlian di Program Studi Biologi, FMIPA, Universitas Mataram. Dalam mata kuliah ini mahasiswa akan mempelajari teknik atau tata cara preparasi bermacam-macam sediaan untuk sepesimen hewan dan tumbuhan. Seperti sediaan awetan dan segar untuk spesimen hewan dan sediaan segar, semiawetan/semipremanen, awetan, kromosom, maserasi dan histokimia. Beberapa teori yang mendukung seperti macam pewarnaan, macam metode preparasi sediaan dan macam serta teknik penggunaan fiksatif akan diberikan dalam tatap muka di kelas. Mahasiswa akan lebih banyak aktif di laboratorium dalam menguasai teknik-teknik preparasi sediaan tumbuhan dan hewan. Keterampilan ini sangat mendukung bidang ilmu lain dalam biologi dan juga menjadi modal keterampilan mahasiswa dalam memecahkan permasalahan di bidang biologi.
2. Capaian Pembelajaran:
- Mahasiswa dapat mengetahui dan menerapkan bagaimana prosedur fiksasi yang tepat untuk jaringan / organ tumbuhan dan hewan yang akan dibuat preparat
- Mahasiswa mengetahui dan mempraktekkan beberapa prosedur/teknik pembuatan preparat dari spesimen tumbuhan dan hewan
- Mahasiswa mengetahui dan mampu menggunakan berbagai macam alat dan bahan yang digunakan dalam mikroteknik
- Mahasiswa mampu menggunakan keterampilan mikroteknik untuk menghasilkan preparat spesimen tumbuhan dan hewan.
- Mahasiswa mampu menerapkan keterampilan mikroteknik dalam memecahkan permasalahan di bidang biologi
3. Bahan Kajian:
- Pengenalan alat dan bahan mikroteknik
- Macam fiksatif dan teknik fiksasi
- Metode pembuatan preparat segar, semiawetan/semipremanen, awetan, kromosom, maserasi dan histokimia.
- Pembuatan preparat dari spesimen tumbuhan
- Pembuatan preparat dari spesimen hewan
- Kesulitan dan solusi dalam mikroteknik
4. Referensi :
- Johansen, D.A., 1940, Plant Microtechnique, McGraw-Hill Book Company, New York.
- Wessner, F.M., 1960, General Zoology Microtechniques, The Williams & Wilkins Company, USA.
- Yeung, E.C.T., C. Stasolla, M.J. Sumner, and B.Q. Huang, 2015, Plant Microtechniques and Protocols, Springer, Switzerland.
- O’Brien, T.P. dan M.E. McCully. 1981. The study of plant structure principles and selected methods.Termarcarphi PTY. LTD. Melbourne.
- O’Brien, T.P., Sutasurya, L. A. and Goenarso, D. 1994. Hand out Microtechnique course. Mataram University, Mataram.
- Johansen, D. A., 1940. Plant microtechnique. McGraw-Hill, New York.
- Peacock, P. and S. Bradbury, 1973. Peacock’selementary microtechnique. 4th edts. The Pitman Press, Bath. Great Britain.
Mikroteknik Hewan Kelas B
Matakuliah Mikroteknik adalah matakuliah wajib untuk dipelajari oleh setiap mahsiswa di program studi biologi. Mikroteknik hewan mengajarkan mahasiswa untuk terampil dalam menyediakan dan membuat preparat segar maupun awetan, dengan metode dan teknik tertentu, sehingga preparat spesimen suatu jaringan atau organ yang dibuat secara mikroskopis, dapat di amati perubahan strukturannya.
PENGELOLAAN LABORATORIUM BIOLOGI
Pengelolaan Laboratorium Biologi (PIB16047) merupakan mata kuliah pilihan semester gasal
bagi mahasiswa S1 Program Studi Biologi Fakultas MIPA Universitas Mataram.
Bobot mata kuliah 2 SKS (1 SKS teori dan 1 SKS praktikum).
Materi kuliah Pengelolaan Laboratorium Biologi meliputi:
1) Pengantar Laboratorium; 2) Tata Letak & Tata Ruang Lab Biologi; 3) SOP Lab Biologi dan K3; 4) Aspek Manajemen Lab Biologi; 5) Pengelolaan Alat dan Bahan Lab dan Prosedur Pengoperasian Alat; 6) Herbarium; 7) Analisis Data; 8) Model Pengelolaan Lab Berbasis Mikrobial dan Lab Lain di Perguruan Tinggi/Lembaga/Instansi; 9) Gene Bank, Kultur Koleksi dan Metode Penyimpanan Isolat; 10) Prosedur layanan mengakses/mendapatkan/membeli isolat secara online; 11) Pengambilan Sampel Lapangan (Prosedur, Ketentuan, dan Depositori); 12} Kunjungan Lab dan Bertemu Ahli.
Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa diharapkan mempunyai pemahaman dan skill dibidang pengelolaan lab biologi.
Perilaku Hewan
Mata kuliah ini membahas tentang perilaku-perilaku yang ditunjukkan oleh hewan sebagai respon atas stimulus yang berasal dari internal dan eksternal tubuh. Perilaku tersebut dapat berupa perilaku yang diturunkan atau dipelajari.
Setelah mengikuti serangkain perkuliahan dan praktikum serta penugasan, mahasiswa diharapkan mampu melakukan desain penelitian dan analisis data perilaku hewan.
PLANKTONOLOGI
Matakuliah ini berisi tentang struktur produktifitas primer/sekunder dan kualitas suatu perairan (studi kasus) berdasarkan metode penelitian planktonologi, analisis klasifikasi plankton di habitat tawar dan laut, analisis distribusi vertikal dan horisontal serta temporal plankton di lingkungan perairan tawar dan laut.
Primatologi
Mata Kuliah ini merupakan mata kuliah pilihan yang akan memberikan pengetahuan dan keterampilan bagi mahasiswa program sarjana dalam menganalisis permasalahan ilmiah yang terkait dengan satwa primata . Dalam mata kuliah ini akan dibahas tentang karakter satwa primata, evolusi dan keanekaragaman satwa primata, ekologi dan perilaku satwa primata, manusia sebagai bagian dari primata
Primatologi
Mata kuliah ini membahas tentang evolusi, keanekaragaman, ekologi dan perilaku ordo Primata.
Setelah menyelesaikan perkuliahan, penugasan, praktikum, mahasiswa diharapkan mampu untuk menganalisis dan mendesain penelitian dan analisis data yang berkaitan dengan hewan-hewan yang termasuk di dalam ordo Primata
TEKNOLOGI MIKROBIAL
Teknologi Mikrobial (PIB16049) merupakan mata kuliah pilihan semester gasal bagi mahasiswa S1 Program Studi Biologi Fakultas MIPA Universitas Mataram. Bobot mata kuliah 3 SKS (2 SKS teori dan 1 SKS praktimum). Mahasiswa dapat memprogramkan mata kuliah ini jika sebelumnya telah menempuh mata kuliah Mikrobiologi (BIO16411) dan Fisiologi Mikrob (BIO16507).
Materi kuliah Teknologi Mikrobial meliputi:
1) History of microbial technology; 2) Nucleic Acids (Structure and Functions) and Genetic Engineering; 3) An overview of microbial Protein, Enzyme, Carbohydrate and Lipid; 4) Fermentation: local raw material and stain; 5) Batch Fermentation; 6) Submerged Culture Fermentation; 7) Solid-State Fermentation; 8) Downstream Processing; 9) Microbial bioproceses in food, chemical, energy, pharmaceutical, cosmetic, and new material industries.
Setelah mengikuti mata kuliah ini, mahasiswa diharapkan mampu:
Referensi:
Smith JE. 2009. Biotechnology. Fifth Ed. Cambridge University Press.
Journal of Microbial Biotechnology 2015 - 2020